Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRJQ12913 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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PTPRJQ12913 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRJQ12913 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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