Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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