Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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FOXO1Q12778 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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