Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREBF2Q12772 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
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