Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 YOR199WYOR199W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 TIM18YOR297C 579 nt1.56□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 ALK1YGL021W 2283 nt1.56□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.55□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YAF9YNL107W 681 nt1.55□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.55□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 KAP122YGL016W 3246 nt1.55□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 RPL35AYDL191W 363 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YJL135WYJL135W 318 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 PFD1YJL179W 330 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 SXM1YDR395W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 UFD2YDL190C 2886 nt1.54□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 ZIP2YGL249W 2115 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 PCC1YKR095W-A 267 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 SDH2YLL041C 801 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 SMC4YLR086W 4257 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 RAD50YNL250W 3939 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 NCA2YPR155C 1851 nt1.53□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 BST1YFL025C 3090 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YDR426CYDR426C 378 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YIL102CYIL102C 306 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 VPS55YJR044C 423 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 CLU1YMR012W 3834 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YOL160WYOL160W 342 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 NUT1YGL151W 3399 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 NUP192YJL039C 5052 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 NOC3YLR002C 1992 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 SSK2YNR031C 4740 nt1.52□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YGL217CYGL217C 342 nt1.51□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YLR140WYLR140W 327 nt1.51□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.51□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YOR376WYOR376W 369 nt1.51□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YBR174CYBR174C 315 nt1.51□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 SEC5YDR166C 2916 nt1.51□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YDR102CYDR102C 333 nt1.5□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 HTB2YBL002W 396 nt1.5□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 CCH1YGR217W 6120 nt1.5□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 PMD1YER132C 5262 nt1.5□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 LAA1YJL207C 6045 nt1.49□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 NPC2YDL046W 522 nt1.49□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 YPL225WYPL225W 441 nt1.49□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 MAD1YGL086W 2250 nt1.49□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 SLX4YLR135W 2247 nt1.48□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 SPC110YDR356W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 NIP100YPL174C 2607 nt1.48□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 TAR1YLR154W-C 375 nt1.47□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 CDC31YOR257W 486 nt1.47□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 VPS54YDR027C 2670 nt1.47□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 SCW11YGL028C 1629 nt1.47□□□□□ -2.17
AVL9Q12500 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 MSH3YCR092C 3057 nt1.46□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 TRM732YMR259C 4263 nt1.46□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YCS4YLR272C 3531 nt1.46□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 RAD34YDR314C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 POL5YEL055C 3069 nt1.46□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 SPC98YNL126W 2541 nt1.45□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 PET127YOR017W 2403 nt1.45□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.45□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 SEC21YNL287W 2808 nt1.44□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 MSN5YDR335W 3675 nt1.44□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 PIK1YNL267W 3201 nt1.44□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YAR029WYAR029W 225 nt1.44□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YDR048CYDR048C 315 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 MAM33YIL070C 801 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 snR14snR14 160 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 EST2YLR318W 2655 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YLL054CYLL054C 2532 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 SLI15YBR156C 2097 nt1.43□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 FYV8YGR196C 2454 nt1.42□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YSY6YBR162W-A 198 nt1.42□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 COG4YPR105C 2586 nt1.41□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YKL118WYKL118W 312 nt1.41□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 YKL136WYKL136W 399 nt1.41□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 snR36snR36 182 nt1.41□□□□□ -2.18
AVL9Q12500 NHP2YDL208W 471 nt1.4□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YJL015CYJL015C 285 nt1.4□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 MDS3YGL197W 4464 nt1.4□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 LCD1YDR499W 2244 nt1.4□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 ALY2YJL084C 3141 nt1.4□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YDL211CYDL211C 1119 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YIR044CYIR044C 186 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 AZF1YOR113W 2745 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 HKR1YDR420W 5409 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 RSM22YKL155C 1887 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 MPT5YGL178W 2580 nt1.39□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YDR413CYDR413C 576 nt1.38□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YFL032WYFL032W 321 nt1.38□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YJR011CYJR011C 786 nt1.38□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.38□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 SPT21YMR179W 2277 nt1.38□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 OST1YJL002C 1431 nt1.38□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 NUP188YML103C 4968 nt1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.6 ms