Protein–RNA interactions for Protein: Q12100

RTK1, Probable serine/threonine-protein kinase RTK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTK1Q12100 UFD4YKL010C 4452 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 MSH6YDR097C 3729 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 SCW11YGL028C 1629 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YFR016CYFR016C 3702 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 SPT21YMR179W 2277 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 SRP14YDL092W 441 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 PDR8YLR266C 2106 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.95□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 UBP2YOR124C 3819 nt1.94□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 HSH155YMR288W 2916 nt1.94□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YBL012CYBL012C 402 nt1.93□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 BRE1YDL074C 2103 nt1.93□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 PAU3YCR104W 375 nt1.92□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YNL028WYNL028W 318 nt1.92□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YMR045CYMR045C 5268 nt1.92□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 APL2YKL135C 2181 nt1.92□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 SPP41YDR464W 4308 nt1.91□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 FKS1YLR342W 5631 nt1.91□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.91□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.91□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 DGR1YNL130C-A 147 nt1.91□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 PIG1YLR273C 1947 nt1.91□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.1
RTK1Q12100 SSS1YDR086C 243 nt1.9□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 CSE2YNR010W 450 nt1.9□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 snR49snR49 165 nt1.9□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 UTP21YLR409C 2820 nt1.9□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 HSL1YKL101W 4557 nt1.9□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 HIR3YJR140C 4947 nt1.9□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 SFB2YNL049C 2631 nt1.89□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 NIP100YPL174C 2607 nt1.89□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 VIK1YPL253C 1944 nt1.89□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 MAD1YGL086W 2250 nt1.89□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 ENV11YGR071C 2583 nt1.89□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 BPH1YCR032W 6504 nt1.89□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 USO1YDL058W 5373 nt1.88□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YIR044CYIR044C 186 nt1.88□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 NEO1YIL048W 3456 nt1.88□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YCK3YER123W 1575 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 TMA7YLR262C-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YNL144CYNL144C 2223 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 RAD34YDR314C 2079 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YJR039WYJR039W 3366 nt1.87□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 SPC98YNL126W 2541 nt1.86□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 PAU2YEL049W 363 nt1.86□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 LHS1YKL073W 2646 nt1.86□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YLR422WYLR422W 5799 nt1.85□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 CUL3YGR003W 2235 nt1.85□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.85□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 RPL34BYIL052C 366 nt1.85□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 FAB1YFR019W 6837 nt1.85□□□□□ -2.11
RTK1Q12100 DNF3YMR162C 4971 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YMR321CYMR321C 318 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YOR218CYOR218C 420 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YBR064WYBR064W 429 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 PTP2YOR208W 2253 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 NOC3YLR002C 1992 nt1.83□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 MYO2YOR326W 4725 nt1.82□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 snR55snR55 98 nt1.82□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.82□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.82□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 PDE2YOR360C 1581 nt1.81□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 PMD1YER132C 5262 nt1.81□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 MPT5YGL178W 2580 nt1.81□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 SPG3YDR504C 384 nt1.81□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 SEC5YDR166C 2916 nt1.81□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YGL052WYGL052W 306 nt1.8□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 RPS27BYHR021C 249 nt1.8□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 INA22YIR024C 651 nt1.8□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.8□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 CTF4YPR135W 2784 nt1.8□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 SLI15YBR156C 2097 nt1.79□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 EMC5YIL027C 426 nt1.79□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.79□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 NUP192YJL039C 5052 nt1.78□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 VPS54YDR027C 2670 nt1.78□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 SAC3YDR159W 3906 nt1.78□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 ABF2YMR072W 552 nt1.78□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.78□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 IES4YOR189W 351 nt1.78□□□□□ -2.12
RTK1Q12100 YLL007CYLL007C 1998 nt1.78□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 LRE1YCL051W 1752 nt1.77□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 SPO24YPR036W-A 204 nt1.77□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 CDC36YDL165W 576 nt1.76□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.76□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 RAD50YNL250W 3939 nt1.76□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 IRC20YLR247C 4671 nt1.76□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 PKH2YOL100W 3246 nt1.75□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.75□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 RPS25BYLR333C 327 nt1.75□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.75□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 PBY1YBR094W 2262 nt1.75□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 SKI3YPR189W 4299 nt1.75□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 FIG2YCR089W 4830 nt1.74□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 COG4YPR105C 2586 nt1.74□□□□□ -2.13
RTK1Q12100 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.74□□□□□ -2.13
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