Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms