Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms