Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms