Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms