Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.16□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 YMR321CYMR321C 318 nt2.16□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 SLN1YIL147C 3663 nt2.16□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 UBR2YLR024C 5619 nt2.16□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 NAB6YML117W 3405 nt2.15□□□□□ -2.06
VHS3Q08438 PAU2YEL049W 363 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 GPG1YGL121C 381 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 IES4YOR189W 351 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YFR016CYFR016C 3702 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YCK3YER123W 1575 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 PDE2YOR360C 1581 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 NOP14YDL148C 2433 nt2.15□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 SPC98YNL126W 2541 nt2.14□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 UBP1YDL122W 2430 nt2.14□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 CAT2YML042W 2013 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 REV3YPL167C 4515 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YOL160WYOL160W 342 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 ZIP1YDR285W 2628 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 HSH155YMR288W 2916 nt2.13□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 MYO4YAL029C 4416 nt2.12□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YBL012CYBL012C 402 nt2.12□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 VPS54YDR027C 2670 nt2.12□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 ENV11YGR071C 2583 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 PAM16YJL104W 450 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YCL023CYCL023C 348 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 MSH5YDL154W 2706 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 DCP2YNL118C 2913 nt2.11□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 MAK10YEL053C 2202 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 MSH6YDR097C 3729 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 SRP14YDL092W 441 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 PFD1YJL179W 330 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YOR302WYOR302W 78 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 SIR4YDR227W 4077 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 YPP1YGR198W 2454 nt2.1□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 PUT3YKL015W 2940 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 Q0032Q0032 291 nt2.09□□□□□ -2.07
VHS3Q08438 MSC6YOR354C 2079 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 SAS3YBL052C 2496 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YDL118WYDL118W 381 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 UBP2YOR124C 3819 nt2.08□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 TDA9YML081W 3756 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 SPO75YLL005C 2607 nt2.07□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 ZIP2YGL249W 2115 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 PDR8YLR266C 2106 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 APL2YKL135C 2181 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 ELG1YOR144C 2376 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 VTC1YER072W 390 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 RPS27BYHR021C 249 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 RRT15YLR162W-A 189 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YPR092WYPR092W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 CTR9YOL145C 3234 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 MGA2YIR033W 3342 nt2.06□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 RLM1YPL089C 2031 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YOR218CYOR218C 420 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 RAD34YDR314C 2079 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 MLH3YPL164C 2148 nt2.05□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 RPL34BYIL052C 366 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YNL198CYNL198C 303 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.04□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YLR419WYLR419W 4308 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 ISD11YER048W-A 285 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 MAD1YGL086W 2250 nt2.03□□□□□ -2.08
VHS3Q08438 AGC1YPR021C 2709 nt2.03□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 BUD2YKL092C 3315 nt2.02□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.02□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 VPS55YJR044C 423 nt2.02□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 HMI1YOL095C 2121 nt2.02□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 NEO1YIL048W 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 PIG1YLR273C 1947 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 DGR2YKL121W 2559 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YJL120WYJL120W 324 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 MYO2YOR326W 4725 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 IRE1YHR079C 3348 nt2.01□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 ATG9YDL149W 2994 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 NOC3YLR002C 1992 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 SEC5YDR166C 2916 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 snR74snR74 88 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YJL182CYJL182C 318 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 ATP7YKL016C 525 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 SPO21YOL091W 1830 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 VPS15YBR097W 4365 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 HIR3YJR140C 4947 nt2□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YIR044CYIR044C 186 nt1.99□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 RPS25BYLR333C 327 nt1.99□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 SGF11YPL047W 300 nt1.99□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YOR093CYOR093C 4947 nt1.99□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YLR294CYLR294C 330 nt1.98□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YBR174CYBR174C 315 nt1.98□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 SEY1YOR165W 2331 nt1.97□□□□□ -2.09
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