Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GOLGA3Q08378 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GOLGA3Q08378 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms