Protein–RNA interactions for Protein: Q08179

MDM38, Mitochondrial distribution and morphology protein 38, yeastyeast

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM38Q08179 SCP160YJL080C 3669 nt2.49□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.49□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 snR46snR46 197 nt2.49□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 RGA1YOR127W 3024 nt2.48□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 SEC16YPL085W 6588 nt2.48□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 YBL012CYBL012C 402 nt2.48□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 STE11YLR362W 2154 nt2.48□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 SPC98YNL126W 2541 nt2.48□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 SGS1YMR190C 4344 nt2.48□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 UBR1YGR184C 5853 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 SIR4YDR227W 4077 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 SRP14YDL092W 441 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 ULI1YFR026C 510 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 snR52snR52 92 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 MCM10YIL150C 1716 nt2.47□□□□□ -2.01
MDM38Q08179 IRC8YJL051W 2469 nt2.46□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 SMC6YLR383W 3345 nt2.46□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 YCL046WYCL046W 324 nt2.46□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 LRE1YCL051W 1752 nt2.46□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 MSC6YOR354C 2079 nt2.45□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 DNF1YER166W 4716 nt2.44□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 ECM12YHR021W-A 456 nt2.44□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 RPS17AYML024W 411 nt2.44□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 MNE1YOR350C 1992 nt2.43□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 SPO75YLL005C 2607 nt2.43□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 SCD5YOR329C 2619 nt2.43□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 ELG1YOR144C 2376 nt2.43□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 APL5YPL195W 2799 nt2.43□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.43□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 ZRG17YNR039C 1818 nt2.42□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 RAV1YJR033C 4074 nt2.42□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 TFC8YPL007C 1767 nt2.42□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 YGR164WYGR164W 336 nt2.42□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.41□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 RPL34BYIL052C 366 nt2.41□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.41□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 USO1YDL058W 5373 nt2.41□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 MET18YIL128W 3099 nt2.4□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 NOP14YDL148C 2433 nt2.4□□□□□ -2.02
MDM38Q08179 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.4□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.4□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 ZIP1YDR285W 2628 nt2.4□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 PUT3YKL015W 2940 nt2.4□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 SPO21YOL091W 1830 nt2.4□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 DCP2YNL118C 2913 nt2.39□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 RLM1YPL089C 2031 nt2.39□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 NUP170YBL079W 4509 nt2.39□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 VTC1YER072W 390 nt2.39□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YBR174CYBR174C 315 nt2.39□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 SPP41YDR464W 4308 nt2.39□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 SSD1YDR293C 3753 nt2.38□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 VPS8YAL002W 3825 nt2.38□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.38□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 ZIP2YGL249W 2115 nt2.38□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 SAS3YBL052C 2496 nt2.37□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YJL120WYJL120W 324 nt2.37□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 COF1YLL050C 432 nt2.37□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 RPS25BYLR333C 327 nt2.37□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 ATP7YKL016C 525 nt2.36□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YNL205CYNL205C 423 nt2.36□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.36□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 RAD34YDR314C 2079 nt2.36□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 SAP190YKR028W 3102 nt2.35□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 IST2YBR086C 2841 nt2.35□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 HSH155YMR288W 2916 nt2.35□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 GIP3YPL137C 3831 nt2.34□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 NAM7YMR080C 2916 nt2.34□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.34□□□□□ -2.03
MDM38Q08179 MAK10YEL053C 2202 nt2.34□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 CUL3YGR003W 2235 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YEL073CYEL073C 324 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YOR345CYOR345C 351 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 CAT2YML042W 2013 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 SAP185YJL098W 3177 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YFR016CYFR016C 3702 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 MAD1YGL086W 2250 nt2.33□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 RPL33BYOR234C 324 nt2.32□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 TUS1YLR425W 3924 nt2.32□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 NOC3YLR002C 1992 nt2.32□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 ENV11YGR071C 2583 nt2.32□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YMR045CYMR045C 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YIR044CYIR044C 186 nt2.31□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 TRL1YJL087C 2484 nt2.31□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 GCN2YDR283C 4980 nt2.31□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YDR341CYDR341C 1824 nt2.31□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 TFC3YAL001C 3483 nt2.3□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 snR85snR85 171 nt2.3□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 UBP2YOR124C 3819 nt2.3□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 APL2YKL135C 2181 nt2.3□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 BUD2YKL092C 3315 nt2.3□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 TOR2YKL203C 7425 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YLL007CYLL007C 1998 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 NCA2YPR155C 1851 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 PMP1YCR024C-A 123 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 RPL31AYDL075W 342 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 BRP1YGL007W 378 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 UTP22YGR090W 3714 nt2.29□□□□□ -2.04
MDM38Q08179 CDC60YPL160W 3273 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms