Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms