Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TYRO3Q06418 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms