Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
REG3AQ06141 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms