Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A2Q05940 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms