Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLE4Q04727 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms