Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP7AQ04656 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms