Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRB3Q04118 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms