Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms