Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
TOP2BQ02880 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOP2BQ02880 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOP2BQ02880 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOP2BQ02880 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2BQ02880 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2BQ02880 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2BQ02880 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TOP2BQ02880 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOP2BQ02880 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
TOP2BQ02880 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms