Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms