Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSF1Q00613 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms