Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELF3P78545 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELF3P78545 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms