Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL11P62913 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms