Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPS28P62857 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS28P62857 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS28P62857 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms