Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms