Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms