Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA1P59665 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms