Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3BP58499 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms