Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEFSECP57772 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms