Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSWP56202 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTSWP56202 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTSWP56202 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTSWP56202 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTSWP56202 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTSWP56202 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSWP56202 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTSWP56202 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms