Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO3P55854 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms