Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms