Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC12A2P55011 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC12A2P55011 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms