Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAD23BP54727 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms