Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PGGT1BP53609 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PGGT1BP53609 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PGGT1BP53609 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGGT1BP53609 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PGGT1BP53609 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PGGT1BP53609 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PGGT1BP53609 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGGT1BP53609 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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