Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN1P49257 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN1P49257 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN1P49257 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN1P49257 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMAN1P49257 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms