Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALDH9A1P49189 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms