Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX1P48742 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHX1P48742 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX1P48742 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX1P48742 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX1P48742 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHX1P48742 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms