Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms