Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms