Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJC1P36383 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJC1P36383 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJC1P36383 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJC1P36383 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms