Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms