Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms