Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPC1P35052 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPC1P35052 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms