Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC1P33527 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms