Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YOR019WYOR019W 2193 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YLL032CYLL032C 2478 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YLR419WYLR419W 4308 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 MEC1YBR136W 7107 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 NPC2YDL046W 522 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YDR426CYDR426C 378 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YJL135WYJL135W 318 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 RPB10YOR210W 213 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 SKI3YPR189W 4299 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 INP2YMR163C 2118 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 HMI1YOL095C 2121 nt1.57□□□□□ -2.16
NDI1P32340 snR72snR72 98 nt1.56□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YIL102CYIL102C 306 nt1.56□□□□□ -2.16
NDI1P32340 SPO24YPR036W-A 204 nt1.56□□□□□ -2.16
NDI1P32340 KCS1YDR017C 3153 nt1.56□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.55□□□□□ -2.16
NDI1P32340 FRK1YPL141C 2598 nt1.55□□□□□ -2.16
NDI1P32340 NUP192YJL039C 5052 nt1.55□□□□□ -2.16
NDI1P32340 HTL1YCR020W-B 237 nt1.54□□□□□ -2.16
NDI1P32340 snR65snR65 100 nt1.54□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YAR029WYAR029W 225 nt1.54□□□□□ -2.16
NDI1P32340 ENV11YGR071C 2583 nt1.54□□□□□ -2.16
NDI1P32340 MLH3YPL164C 2148 nt1.54□□□□□ -2.16
NDI1P32340 CTF4YPR135W 2784 nt1.53□□□□□ -2.16
NDI1P32340 KIP1YBL063W 3336 nt1.53□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YER181CYER181C 324 nt1.53□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.53□□□□□ -2.16
NDI1P32340 SBE22YHR103W 2559 nt1.53□□□□□ -2.17
NDI1P32340 DBP6YNR038W 1890 nt1.52□□□□□ -2.17
NDI1P32340 SFB2YNL049C 2631 nt1.52□□□□□ -2.17
NDI1P32340 SAC3YDR159W 3906 nt1.52□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.52□□□□□ -2.17
NDI1P32340 CAT8YMR280C 4302 nt1.52□□□□□ -2.17
NDI1P32340 SSK2YNR031C 4740 nt1.51□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YLR422WYLR422W 5799 nt1.51□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YGL149WYGL149W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.51□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YBR174CYBR174C 315 nt1.51□□□□□ -2.17
NDI1P32340 SXM1YDR395W 2835 nt1.51□□□□□ -2.17
NDI1P32340 SAS3YBL052C 2496 nt1.5□□□□□ -2.17
NDI1P32340 PIG1YLR273C 1947 nt1.5□□□□□ -2.17
NDI1P32340 CCH1YGR217W 6120 nt1.5□□□□□ -2.17
NDI1P32340 DGR2YKL121W 2559 nt1.5□□□□□ -2.17
NDI1P32340 PFD1YJL179W 330 nt1.5□□□□□ -2.17
NDI1P32340 APL2YKL135C 2181 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 PAU2YEL049W 363 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YOL160WYOL160W 342 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 CDC31YOR257W 486 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YPR063CYPR063C 423 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 NIP100YPL174C 2607 nt1.49□□□□□ -2.17
NDI1P32340 BST1YFL025C 3090 nt1.48□□□□□ -2.17
NDI1P32340 PIK1YNL267W 3201 nt1.48□□□□□ -2.17
NDI1P32340 ZIP2YGL249W 2115 nt1.48□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.48□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YJL022WYJL022W 309 nt1.48□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.48□□□□□ -2.17
NDI1P32340 ALK1YGL021W 2283 nt1.47□□□□□ -2.17
NDI1P32340 CHS1YNL192W 3396 nt1.47□□□□□ -2.17
NDI1P32340 YDR344CYDR344C 444 nt1.47□□□□□ -2.17
NDI1P32340 IRA1YBR140C 9279 nt1.47□□□□□ -2.17
NDI1P32340 SPC98YNL126W 2541 nt1.47□□□□□ -2.17
NDI1P32340 PMD1YER132C 5262 nt1.47□□□□□ -2.17
NDI1P32340 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.46□□□□□ -2.18
NDI1P32340 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
NDI1P32340 YIL032CYIL032C 357 nt1.46□□□□□ -2.18
NDI1P32340 COF1YLL050C 432 nt1.46□□□□□ -2.18
NDI1P32340 NCA2YPR155C 1851 nt1.46□□□□□ -2.18
NDI1P32340 MPT5YGL178W 2580 nt1.45□□□□□ -2.18
NDI1P32340 SDH2YLL041C 801 nt1.45□□□□□ -2.18
NDI1P32340 MAD1YGL086W 2250 nt1.45□□□□□ -2.18
NDI1P32340 SPC110YDR356W 2835 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 OST1YJL002C 1431 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 POL5YEL055C 3069 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 RAD34YDR314C 2079 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 ADR1YDR216W 3972 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 PET127YOR017W 2403 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 KAP122YGL016W 3246 nt1.44□□□□□ -2.18
NDI1P32340 SSS1YDR086C 243 nt1.43□□□□□ -2.18
NDI1P32340 ANS1YHR126C 480 nt1.43□□□□□ -2.18
NDI1P32340 YLR140WYLR140W 327 nt1.43□□□□□ -2.18
NDI1P32340 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.43□□□□□ -2.18
NDI1P32340 snR60snR60 104 nt1.42□□□□□ -2.18
NDI1P32340 ALG13YGL047W 609 nt1.42□□□□□ -2.18
NDI1P32340 EMC5YIL027C 426 nt1.42□□□□□ -2.18
NDI1P32340 SMC4YLR086W 4257 nt1.42□□□□□ -2.18
NDI1P32340 YDL211CYDL211C 1119 nt1.41□□□□□ -2.18
NDI1P32340 YHL042WYHL042W 453 nt1.41□□□□□ -2.18
NDI1P32340 VPS55YJR044C 423 nt1.41□□□□□ -2.18
NDI1P32340 SPT21YMR179W 2277 nt1.41□□□□□ -2.18
NDI1P32340 NOC3YLR002C 1992 nt1.4□□□□□ -2.19
NDI1P32340 YCK3YER123W 1575 nt1.4□□□□□ -2.19
NDI1P32340 LCD1YDR499W 2244 nt1.4□□□□□ -2.19
NDI1P32340 SCW11YGL028C 1629 nt1.4□□□□□ -2.19
NDI1P32340 FYV8YGR196C 2454 nt1.4□□□□□ -2.19
NDI1P32340 RAD50YNL250W 3939 nt1.39□□□□□ -2.19
NDI1P32340 COG8YML071C 1824 nt1.39□□□□□ -2.19
NDI1P32340 YGR069WYGR069W 336 nt1.39□□□□□ -2.19
NDI1P32340 INA22YIR024C 651 nt1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.5 ms