Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTX2P32243 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTX2P32243 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTX2P32243 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms